اندازه گیری های لازم را روی نمونه خود انجام دهید. اندازه های می توانند از MicroATX تا  ATX Super Tower  متفاوت باشند.در برخی موارد می تواند بخش مربوط به فضای هوا را  در یک سیستم خنک کننده مایع حذف کرد اما ساخت  آن نیاز به دقت بیشتری دارد و توضیح آن از این مقاله فراتر است.یک مورد با اندازه حداقل ATX Mid-Tower توصیه می شود. همچمین  اطمینان حاصل کنید که سیستم مورد نظر شما به اندازه کافی جریان هوا را بعد از نصب فراهم می کند.یک سیستم خنک کننده مایع خوب بدون در نظر گرفتن درست جریان هوا به یک آبگرمکن تبدیل می شود!

سیستم خود را به طور کامل قبل از خرید قطعات طراحی کنید. این که تمام قطعات را بخواهید در نظر بگیرد کار سختی است . اما می توانید یک تصویر از سیستم را رسم  کنید و یا در ذهن خود تجسم کنید. مطمئن شوید همه قطعات با هم سازگاری دارند و تمامی اتصالات مربوط به برق و منبع تغذیه بدون مشکل هستند. 

انتخاب مایع:خنک کننده  بخشی است که گرما را در سیستم منتقل می کند.بسیاری از سیستم ها از اب مقطر استفاده می کنند که هم ارزان است و هم جایگزین کردن آن ساده است در صورت تمایل  می توانید از مایع رنگی یا مایع فلورسنت استفاده کنید. البته حتما باید  در این مورد از فروشنده سوال کنید و در این خصوص اطمینان حاصل کنید  چون در غیر این صورت مواد رنگی باعث سفت شدن مایع و ایجاد رسوب می شود.

تمام قطعات مورد نظر را بر روی یک سطح جمع آوری کنید. میتوانید یک ورقه سفید را برای این کار انتخاب کنید و تمام قطعات کوچک و بزرگ موردنیازتان را روی  آن قرار دهید. 

سیستم خنک کننده قبلی را بردارید. میتوانید با استفاده از یک پارچه تمیز آثار به جا مانده از خمیر حرارتی را پاک کنید. 

فضای لازم برای سیستم جدید را ایجاد کنید.

• ممکن است در قسمتی که قرار است رادیاتور قرار بگیرد صفحات پوششی کیس قرار دادشته باشد که می بایست قبل از شروع به کار این صفحات برداشته شود و تمامی پورت ها قابل مشاهده باشند.
• دقت شود که از کابل های استاندارد استفاده شود کابل های ضعیف  می تواند مدیریت و دسترسی به اجزا را محدود و مانع از عملکرد صحیح سیستم خنک کننده شود.

نصب بلاک آب.

• مقدار کمی از خمیر حرارتی را به شکل یک نقطه کمی کوچکتر از یک نخود را  روی cpu ،درست در مرکز آن قرار دهید. 
• در صورتی که بلاک  اب دارای پیچ است سعی کنید به ارامی و هماهنگ  پیچ ها را ببندید چون فشار ناهمسان  به پردازنده اسیب می رساند.

نصب رادیاتور. از اتصال درست رادیاتور و اینکه  جریان هوا به درستی در قسمت جلو و پشت رادیاتور برقرار است اطمینان حاصل کنید. 

نصب پمپ و مخزن.در صورتی که پمپ و مخزن در حالت ایستاده  و ازادقرار دارند مطمئن شوید که به درستی در کیس قرار گرفته اند و مانع از جریان هوا نمی شوند.

اضافه کردن لوله و بستن انها.قبل از بستن لوله ها آنها را درون کیس بررسی کنید. دقت کنید هر چند طول لوله ها درون کیس مهم است اما اولویت با خم نبودن لوله ها درون کیس است زیرا وجود  پیچ در لوله  عملکرد سیستم را به شدت کاهش میدهد و فشار زیادی به موتور وارد می سازد.می توانید در جاهایی که نیاز ست لوله را برش دهید اما دقت کنید که هر چه طول لوله کمتر باشد بهتر است.

بررسی سیستم.مطمئن شوید که تما اتصالات محکم شده اند و لوله و قطعات عاری از هر گونه ترک هستند. 

پر کردن با مایع.مخزن را به اندازه 90% از مایع پر کنید. 

سیستم را روشن کنید. هنگامی که سیستم را روشن می کنید به احتمال زیاد مخزن تخلیه شده است. سیستم را خاموش کنید و مجدد مخزن را تا 90% پر کنید. 

به مدت 24 ساعت اجازه دهید تا سیستم کار کند و نشتی مایع در سیستم را بررسی کنید.به صدای پمپ یا رادیاتور گوش دهید.برخی صداها  نشانه کار کردن قطعات است اما صداهای مثل صدای پیچ ها و یا صدای چکه می تواند نشان از وجود مشکل باشد.